Spatial Imaging Mass Cytometry and Transcriptomics – SIMCaT

La plateforme SIMCaT, située à l’Institut de Recherche en Cancérologie de Montpellier, est la première structure en France à s’être dotée du système d’imagerie par cytométrie de masse, l’Hyperion. Développé par Standard Biotools, l’Hyperion est un module d’imagerie qui, associé à l’Helios, un CyTOF de 3eme génération, permet l’analyse tissulaire par spectrométrie de masse. Ce type de détection du signal permet d’utiliser des panels d’anticorps complexes et hautement multiplexés (jusqu’à 50 paramètres pour l’Hélios, plus de 35 pour l’Hypérion) tout en s’affranchissant des limites de la fluorescence (l’autofluorescence, le chevauchement spectral et l’instabilité des fluorochromes). La plateforme propose l’acquisition d’échantillons en suspension (Hélios) et tissulaires (Hypérion) ainsi que différentes prestations (couplage des anticorps, validation et titration des panels d’anticorps, marquages IMC, analyse bio-informatique, …). La plateforme SIMCaT a récemment élargit son offre en acquérant le Xenium (10x Technology) qui permet une analyse transcriptomique des tissus à l’échelle de la cellule unique.

La Plateforme SIMCaT a bénéficié notamment du soutien financier de la Région Occitanie et de l’Union Européenne via le FEDER.