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Nouveau plateau expérimental dédié à l’analyse de l’épigénome

En janvier 2025, le SIRIC Montpellier Cancer inaugure un nouveau plateau expérimental dédié à l’analyse de l’épigénome, basé sur la technologie ATAC-seq, et accessible à toutes les équipes de recherche du SIRIC Montpellier Cancer.

Ce plateau a pour objectif de répondre aux besoins des équipes de recherche du SIRIC qui souhaitent finaliser la caractérisation de leurs modèles d’étude ou de leurs collections biologiques.

Contact : Noémie Legoff

Fonctionnement de la plateforme ATAC-seq

La première étape se déroule au laboratoire d’Eric Soler à l’Institut de Génétique Moléculaire de Montpellier (IGMM)

Dès janvier 2025, Noémie Legoff, ingénieure, soutenue par Charlotte Andrieu-Soler (CRCN-Inserm), sera responsable de la construction des librairies de données à partir des échantillons (frais ou congelés) fournis par l’équipe de recherche utilisatrice de la plateforme.

Cette étape n°1 est prise en charge par le SIRIC Montpellier Cancer.

La deuxième étape est coordonnée par l’équipe d’Eric Soler et est externalisée.

Les frais associés à cette étape n°2 sont à la charge de l’équipe de recherche utilisatrice de la plateforme.

La troisième étape doit être réalisée par l’équipe de recherche, qui aura au préalable suivi une formation à la technologie ATAC-seq.

Une formation spécifique sera dispensée par le cluster bioinformatique du SIRIC Montpellier Cancer en mars 2025 (voir ci-dessous).

Fonctionnement de la plateforme ATAC-seq

Formation ATAC-seq

Le SIRIC Montpellier Cancer et son Cluster Bioinformatique sont ravis de vous inviter à une formation sur la technologie ATAC-seq : « Unlocking Epigenomic Insights: ATAC-seq Data Analysis in Practice » 

  • Dates : 24 au 26 mars 2025
  • Lieu : Genopolys, Montpellier
  • Frais de participation : 100% gratuit
  • Equipe de formation : Pierre-François Roux, PhD (Epigénéticien, IRCM), Michaël Patron (Ingénieur d’étude, IRCM), Dassou Sika (Ingénieure d’étude, IGF/IGH) et Mohammad Salma, PhD (Bio-informaticien, IRCM)

👉 Télécharger le programme de la formation  : ATAC-seq_Training_Program

👉 S’inscrire à la formation

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Avec le soutien financier de l’INCa, la DGOS, et l’Inserm