Nouvelle plateforme de Biologie Spatiale à l’IRCM – SIMCaT

C’est avec le soutien du SIRIC Montpellier Cancer qu’une nouvelle plateforme SIMCaT (Spatial Imaging Mass Cytometry and Transcriptomics) vient d’être créée à l’IRCM: elle est composée d’une part, d’un plateau déjà existant de protéomique spatiale par imagerie par cytométrie de masse (Hyperion/Helios) et d’autre part, d’un plateau de transcriptomique spatiale ouvert cette année grâce à l’acquisition d’un équipement Xenium (10X Genomics). Ces deux technologies permettent de combiner des informations, à l’échelle de la cellule unique, sur la position spatiale dans le tissu de l’expression des gènes (panels de 150 à 1000 gènes) et de marqueurs protéiques (panels de 45 marqueurs). Cette association, unique à ce jour en France, au sein de la plateforme SIMCaT positionne l’IRCM et le SIRIC Montpellier Cancer à la pointe de la recherche par son expertise dans l’analyse des écosystèmes tissulaires et en particulier des écosystèmes tumoraux.