Plateforme d’analyse ATAC-seq
Nouveau plateau expérimental dédié à l’analyse de l’épigénome
En janvier 2025, le SIRIC Montpellier Cancer inaugure un nouveau plateau expérimental dédié à l’analyse de l’épigénome, basé sur la technologie ATAC-seq, et accessible à toutes les équipes de recherche du SIRIC Montpellier Cancer.
Ce plateau a pour objectif de répondre aux besoins des équipes de recherche du SIRIC qui souhaitent finaliser la caractérisation de leurs modèles d’étude ou de leurs collections biologiques.
Contact : Noémie Legoff
Fonctionnement de la plateforme ATAC-seq
La première étape se déroule au laboratoire d’Eric Soler à l’Institut de Génétique Moléculaire de Montpellier (IGMM)
Dès janvier 2025, Noémie Legoff, ingénieure, soutenue par Charlotte Andrieu-Soler (CRCN-Inserm), sera responsable de la construction des librairies de données à partir des échantillons (frais ou congelés) fournis par l’équipe de recherche utilisatrice de la plateforme.
Cette étape n°1 est prise en charge par le SIRIC Montpellier Cancer.
La deuxième étape est coordonnée par l’équipe d’Eric Soler et est externalisée.
Les frais associés à cette étape n°2 sont à la charge de l’équipe de recherche utilisatrice de la plateforme.
La troisième étape doit être réalisée par l’équipe de recherche, qui aura au préalable suivi une formation à la technologie ATAC-seq.
Une formation spécifique sera dispensée par le cluster bioinformatique du SIRIC Montpellier Cancer en mars 2025 (voir ci-dessous).
Formation ATAC-seq
Le SIRIC Montpellier Cancer et son Cluster Bioinformatique ont organisé en mars 2025 la première formation ATAC-seq : « Unlocking Epigenomic Insights: ATAC-seq Data Analysis in Practice »
👉 Télécharger le programme de la formation : ATAC-seq_Training_Program
👉 Lire le bilan de cette première édition
RDV en 2026 pour une prochaine édition !
