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Atelier d’analyses de données génomiques – 20/23 mai 2019

Atelier_Bioinformatique_CNRS_entreprise_2019

Organisation du 20 au 23 mai 2019 d’un atelier de 4 jours sur les bases du traitement et de l’analyse de données de type ChIP-seq, RNA-seq et HI-C.

Les principaux objectifs de cet atelier sont les suivants:

- Savoir planifier une expérience simple de type ChIP-seq ou RNA-seq

– Savoir évaluer la qualité des données obtenues dans le cadre de la régulation des gènes (ChIP-seq) et de l’analyse du transcriptome (RNA-seq)

– Maîtriser les principales méthodes et outils d’analyse des données ChIP-seq et RNA-seq

– Savoir les visualiser dans un navigateur de génome et en extraire les coordonnées des pics enrichis

– Savoir manipuler et annoter les fichiers d’enrichissement (bedtools, DAVID)

– Maîtriser les principales méthodes d’analyse des données Hi-C et de génération des cartes de contact chromosomique

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